Текущий выпуск Номер 3, 2026 Том 18

Все выпуски

Результаты поиска по 'analytical model':
Найдено статей: 112
  1. Якушевич Л.В., Рясик А.А.
    Динамические характеристики кинков и антикинков ДНК
    Компьютерные исследования и моделирование, 2012, т. 4, № 1, с. 209-217

    В данной работе в рамках модели синус-Гордона рассчитываются динамические характеристики кинков и антикинков, активированных в однородных полинуклеотидных цепочках, каждая из которых содержит только один из видов оснований: аденины, тимины, гуанины или цитозины. Получены аналитические формулы и построены графики для профилей кинков и антикинков и для плотности их энергии в 2D- и 3D-формате. Вычислены масса кинков и антикинков, их энергия покоя и размеры. Рассчитаны траектории движения кинков и антикинков в фазовом пространстве в 2D- и 3D-формате.

    Ключевые слова: математическое моделирование, уравнение синус-Гордона, подвижность ДНК, биофизика.
    Yakushevich L.V., Ryasik A.A.
    Dynamical characteristics of DNA kinks and antikinks
    Computer Research and Modeling, 2012, v. 4, no. 1, pp. 209-217

    In this article in the frameworks of the sine-Gordon mode we have calculated the dynamical characteristics of kinks and antikinks activated in the homogeneous polynucleotide chains each if them contains only one of the types of the bases: adenines, thymines, guanines or cytosines. We have obtained analytical formulas and constructed the graphs for the kink and antikink profiles and for their energy density in the 2D- and 3D-dimension. Mass of kinks and antikinks, their energy of rest and their size have been estimated. The trajectories of kink and antikink motion in the phase space have been calculated in the 2D- and 3D-dimension.

    Keywords: mathematical modeling, sine-Gordon equation, DNA-mobility, biophysics.
    Просмотров за год: 2. Цитирований: 7 (РИНЦ).
  2. Плюснина Т.Ю., Воронова Е.Н., Гольцев В.Н., Погосян С.И., Яковлева О.В., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б.
    Редуцированная модель фотосистемы II для оценки характеристик фотосинтетического аппарата по данным индукции флуоресценции
    Компьютерные исследования и моделирование, 2012, т. 4, № 4, с. 943-958

    Рассматривается подход для анализа некоторых биологических систем большой размерности, для которых справедливы предположения о квазиравновесных стадиях. Подход позволяет редуцировать детальные модели большой размерности и получить упрощенные модели, имеющие аналитическое решение. Это дает возможность достаточно точно воспроизводить экспериментальные кривые. Рассматриваемый подход был применен к детальной модели первичных процессов фотосинтеза в реакционном центре фотосистемы II. Упрощенная модель фотосистемы II хорошо описывает экспериментальных кривые индукции флуоресценции для высших и низших растений, полученные при разных интенсивностях света. Выведенные соотношения между переменными и параметрами детальной и упрощенной моделей, позволили использовать полученные оценки параметров упрощенной модели для описания динамики различных состояний фотосистемы II детальной модели.

    Ключевые слова: фотосистема II, кривая индукции флуоресценции, редукция модели.
    Plusnina T.Yu., Voronova E.N., Goltzev V.N., Pogosyan S.I., Yakovleva O.V., Riznichenko G.Yu., Rubin A.B.
    Reduced model of photosystem II and its use to evaluate the photosynthetic apparatus characteristics according to the fluorescence induction curves
    Computer Research and Modeling, 2012, v. 4, no. 4, pp. 943-958

    The approach for the analysis of some large-scale biological systems, on the base of quasiequilibrium stages is proposed. The approach allows us to reduce the detailed large-scaled models and obtain the simplified model with an analytical solution. This makes it possible to reproduce the experimental curves with a good accuracy. This approach has been applied to a detailed model of the primary processes of photosynthesis in the reaction center of photosystem II. The resulting simplified model of photosystem II describes the experimental fluorescence induction curves for higher and lower plants, obtained under different light intensities. Derived relationships between variables and parameters of detailed and simplified models, allow us to use parameters of simplified model to describe the dynamics of various states of photosystem II detailed model.

    Keywords: photosystem II, fluorescence induction curves, model reduction.
    Просмотров за год: 3. Цитирований: 2 (РИНЦ).
Страницы: « первая предыдущая

Журнал индексируется в Scopus

Полнотекстовая версия журнала доступна также на сайте научной электронной библиотеки eLIBRARY.RU

Журнал входит в систему  Российского индекса научного цитирования.

Журнал включен в базу данных Russian Science Citation Index (RSCI) на платформе Web of Science

Международная Междисциплинарная Конференция "Математика. Компьютер. Образование"

Международная Междисциплинарная Конференция МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ.

Website Copyright © 2009–2026 Институт компьютерных исследований