Наиболее цитируемые статьи (РИНЦ)

231. Мокин А.Ю.
     О спектральных свойствах одного несамосопряженного разностного оператора
     Компьютерные исследования и моделирование, 2010, т. 2, № 2, с. 143-150

     Рассмотрена задача на собственные значения для несамосопряжённого разностного оператора с переменным коэффициентом. Особенность задачи заключается в нелокальных граничных условиях специального вида, которым удовлетворяет решение. В весьма общих предположениях относительно переменного коэффициента определена кратность собственных чисел, построена область локализации спектра оператора.

     Ключевые слова: задача на собственные значения, несамосопряжённый разностный оператор.
     Просмотров за год: 1. Цитирований: 2 (РИНЦ).
232. Асылбаев Н.А.
     Математическое моделирование распространения степного пожара
     Компьютерные исследования и моделирование, 2010, т. 2, № 4, с. 377-384

     Методом математического моделирования на основе метода крупных частиц исследуется динамика распространения пожара в однородном степном массиве.

     Ключевые слова: моделирование, степной пожар.
     Просмотров за год: 3. Цитирований: 2 (РИНЦ).
233. Потапов И.С., Волков Е.И.
     Анализ динамических режимов взаимодействующих синтетических генетических репрессиляторов
     Компьютерные исследования и моделирование, 2010, т. 2, № 4, с. 403-418

     В работе изучена динамика двух искусственных генетических осцилляторов — репрессиляторов, — связанных диффузией аутоиндуктора. Выбрана модель генетической сети, в которой производство, диффузия и ген-мишень для аутоиндуктора обеспечивают расталкивающее взаимодействие между фазовыми точками. Исследовано появление периодических режимов, устойчивых неоднородных стационарных состояний в зависимости от главных бифуркационных параметров: силы связи и скорости синтеза мРНК. Показано, что добавление в генетическую схему аутоиндуктора приводит к исчезновению предельного цикла через бифуркацию бесконечного периода в изолированном осцилляторе, если скорость синтеза мРНК велика. Найден гистерезис между предельным циклом и стационарным состоянием, размер которого зависит от соотношения времен жизни мРНК и белков. Взаимодействие двух осцилляторов приводит к появлению устойчивого противофазного предельного цикла, который может переходить в хаотический режим через «тор-хаос» или путем каскада Фейгенбаума.

     Ключевые слова: осциллятор, генетическая сеть, аутоиндуктор, бифуркационный анализ.
     Просмотров за год: 2. Цитирований: 2 (РИНЦ).
234. Нечипуренко Ю.Д., Нечипуренко Д.Ю., Ильичева И.А., Головкин М.В., Панченко Л.А., Полозов Р.В., Гроховский С.Л.
     Конформационно-динамические свойства ДНК и подходы к физическому картированию генома
     Компьютерные исследования и моделирование, 2010, т. 2, № 4, с. 419-428

     Ранее нами был предложен и развит метод исследования ДНК, основанный на расщеплении двунитевых фрагментов ДНК под действием ультразвука. Были получены относительные частоты расщепления фосфодиэфирной связи во всех 16 динуклеотидах. Увеличение базы проанализированных данных до 20 тысяч нуклеотидов позволил получить относительные частоты расщепления для 256 тетрануклеотидов. Эти величины количественно характеризуют влияние последовательности нуклеотидов на конформационную динамику сахарофосфатного остова. Сейчас известны определённые типы гетерогенности сахарофосфатного остова ДНК, связанные с расщеплением ДНК различными химическими агентами или ДНКазой 1. Гетерогенность свойств молекулы ДНК может быть использована для физического картирования генома, то есть определения участков, отвечающих за регуляцию генетический экспрессии.

     Ключевые слова: ультразвуковое расщепление ДНК, динамика молекулы ДНК, подвижность молекулы ДНК, d(CpG) динуклеотид.
     Просмотров за год: 2. Цитирований: 2 (РИНЦ).
235. Новиков О.А., Ровенская О.Г.
     Приближение периодических функций высокой гладкости прямоугольными линейными методами
     Компьютерные исследования и моделирование, 2011, т. 3, № 3, с. 255-264

     Получены асимптотические формулы для верхних граней уклонений прямоугольных сумм Валле Пуссена на классах периодических функций двух переменных высокой гладкости. Эти соотношения в некоторых важных случаях обеспечивают решение известной задачи Колмогорова–Никольского для прямоугольных сумм Валле Пуссена и указанных классов функций.

     Ключевые слова: (ψ, β)-производная, прямоугольные суммы Валле Пуссена, задача Колмогорова–Никольского.
     Цитирований: 2 (РИНЦ).
236. Жмуров А.А., Барсегов В.А., Трифонов С.В., Холодов Я.А., Холодов А.С.
     Эффективные генераторы псевдослучайных чисел при молекулярном моделировании на видеокартах
     Компьютерные исследования и моделирование, 2011, т. 3, № 3, с. 287-308

     Динамика Ланжевена, метод Монте-Карло и моделирование молекулярной динамики в неявном растворителе требуют больших массивов случайных чисел на каждом шаге расчета. Мы исследовали два подхода в реализации генераторов на графических процессорах. Первый реализует последовательный алгоритм генератора на каждом потоке в отдельности. Второй основан на возможности взаимодействия между потоками и реализует общий алгоритм на всех потоках в целом. Мы покажем использование этих подходов на примере алгоритмов Ran 2, Hybrid Taus и Lagged Fibonacci. Для проверки случайности полученных чисел мы использовали разработанные генераторы при моделировании динамики Ланжевена N независимых гармонических осцилляторов в термостате. Это позволило нам оценить статистические характеристики генераторов. Мы также исследовали производительность, использование памяти и ускорение, получаемое при переносе алгоритма с центрального на графический процессор.

     Ключевые слова: псевдослучайные числа, графический процессор, генератор, молекулярное моделирование.
     Просмотров за год: 11. Цитирований: 2 (РИНЦ).
237. Якушевич Л.В.
     Биомеханика ДНК: вращательные колебания оснований
     Компьютерные исследования и моделирование, 2011, т. 3, № 3, с. 319-328

     В данной работе изучаются вращательные колебания азотистых оснований, образующих центральную пару в коротком фрагменте ДНК, состоящем из трех пар оснований. Построен простой механический аналог фрагмента, в котором основания имитируются маятниками, а взаимодействия между основаниями — пружинками. Получен лагранжиан модельной системы и уравнения движения. Получены решения уравнений движения для однородного случая, когда рассматриваемый фрагмент ДНК состоит из одинаковых пар оснований: из пар аденин-тимин (AT) или гуанинцитозин (GC). Построены траектории модельной системы в конфигурационном пространстве.

     Ключевые слова: ДНК, моделирование, вращательные колебания оснований.
     Просмотров за год: 3. Цитирований: 2 (РИНЦ).
238. Горшенин А.К.
     О применении асимптотических критериев для определения числа компонент смеси вероятностных распределений
     Компьютерные исследования и моделирование, 2012, т. 4, № 1, с. 45-53

     В статье демонстрируется практическая эффективность применения асимптотически наиболее мощных критериев проверки гипотез о числе компонент смеси в моделях добавления и расщепления компонент. Тестовые данные представляют собой выборки из различных конечных смесей нормальных законов. Проводится сравнение результатов для разнообразных уровней значимости и весов.

     Ключевые слова: конечная смесь нормальных распределений, асимптотически наиболее мощный критерий.
     Просмотров за год: 1. Цитирований: 2 (РИНЦ).
239. Будак В.П., Желтов В.С., Калакуцкий Т.К.
     Локальные оценки метода Монте-Карло в решении уравнения глобального освещения с учетом спектрального представления объектов
     Компьютерные исследования и моделирование, 2012, т. 4, № 1, с. 75-84

     В статье рассматриваются локальная и двойная локальная оценка метода Монте-Карло при решении уравнения глобального освещения. Локальная оценка позволяет в диффузном приближении рассчитывать освещенность в произвольной точке, тогда как двойная локальная оценка позволяется вычислять непосредственно яркость в заданной точке по заданному направлению. В статье дается математическое обоснование локальных оценок и рассмотрены основные этапы реализации программного обеспечения. Также рассматривается представление трехмерных объектов в базисе сферических функций и возможность использования их в локальных оценках.

     Ключевые слова: глобальное освещение, Монте-Карло, локальная оценка, двойная локальная оценка.
     Цитирований: 2 (РИНЦ).
240. Дьяченко Е.Н., Дик И.Г.
     Моделирование образования седиментационного и фильтрационного слоев методом дискретных элементов
     Компьютерные исследования и моделирование, 2012, т. 4, № 1, с. 105-120

     В работе предлагается численная модель седиментации и фильтрования суспензии, основанная на динамическом варианте метода дискретных элементов. Эта модель отражает поведение частиц на микро- и мезоуровне: образование пор, арок, хлопьев. Кроме того, предложенная модель качественно воспроизводит макроэффекты: осаждение слоя частиц, медленные процессы усадки этого слоя, уплотнения слоя под действием собственного веса частиц и приложенной извне силы.

     Ключевые слова: образование седиментационного слоя, консолидация фильтрационного слоя, метод дискретных элементов.
     Просмотров за год: 1. Цитирований: 2 (РИНЦ).

• Общая информация
• Политика открытого доступа
• Публикационная этика
• Редакционная коллегия
• Авторский указатель
• Для авторов
• Для рецензентов
• Контакты
• Часто просматриваемые статьи
• Наиболее цитируемые статьи
• Подача статей ONLINE