[ Switch to English ]

Моделирование пространственно-временной динамики циркадианных ритмов Neurospora crassa

В работе предложена новая модель циркадианных колебаний нейроспоры, которая описывает пространственно-временную динамику белков, ответственных за механизм биоритмов. Модель основывается на нелинейном взаимодействии белков FRQ и WCC, кодируемых генами frequency и white collar, и включает в себя как положительную, так и отрицательную петлю обратной связи. Главным элементом механизма колебаний является эффект запаздывания в биохимических реакциях транскрипции генов. Показано, что модель воспроизводит такие свойства циркадианных колебаний нейроспоры как захват частоты под действием внешнего периодического освещения, сброс фазы биоритмов при воздействии импульса света, устойчивость механизма колебаний по отношению к случайным флуктуациям и т. д. Исследованы волновые структуры, возникающие в ходе пространственной эволюции системы. Показано, что волны синхронизации биоритмов среды возникают под воздействием базального транскрипционного фактора.

Ключевые слова: запаздывание, стохастические системы, циркадианные ритмы, генная регуляция
Цитата: Брацун Д.А., Захаров А.П. Моделирование пространственно-временной динамики циркадианных ритмов Neurospora crassa // Компьютерные исследования и моделирование, 2011, т. 3, № 2, с. 191-213
Citation in English: Bratsun D.A., Zakharov A.P. Modelling spatio-temporal dynamics of circadian rythms in Neurospora crassa // Computer Research and Modeling, 2011, vol. 3, no. 2, pp. 191-213
DOI: 10.20537/2076-7633-2011-3-2-191-213
Creative Commons License Статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution-NoDerivs 3.0 Unported License.
Информация о цитировании статьи по данным Crossref:
  • Dmitry Anatolievich Bratsun. Effect of subcritical excitation of oscillations in stochastic systems with time delay. Part I. Regulation of gene expression. // Computer Research and Modeling. 2011. — V. 3, no. 4. — P. 421. DOI: 10.20537/2076-7633-2011-3-4-421-438
  • Dmitry Anatolievich Bratsun, Alexey V. Zyuzgin. Effect of subcritical excitation of oscillations in stochastic systems with time delay. Part II. Control of fluid equilibrium. // Computer Research and Modeling. 2012. — V. 4, no. 2. — P. 369. DOI: 10.20537/2076-7633-2012-4-2-369-389
  • Dmitry Anatolievich Bratsun, Andrey Pavlovich Zakharov, Len M. Pismen. Multiscale mathematical modeling occurrence and growth of a tumour in an epithelial tissue. // Computer Research and Modeling. 2014. — V. 6, no. 4. — P. 585. DOI: 10.20537/2076-7633-2014-6-4-585-604
  • Dmitry Anatolievich Bratsun, Eugeny Sergeevich Lorgov, Alexander Olegovich Poluyanov. Repressilator with time-delayed gene expression. Part I. Deterministic description. // Computer Research and Modeling. 2018. — V. 10, no. 2. — P. 241. DOI: 10.20537/2076-7633-2018-10-2-241-259
  • Andrey Pavlovich Zakharov, Dmitry Anatolievich Bratsun. Synchronization of circadian rhythms in the scale of a gene, a cell and a whole organism. // Computer Research and Modeling. 2013. — V. 5, no. 2. — P. 255. DOI: 10.20537/2076-7633-2013-5-2-255-270
Сведения о цитировании могут быть существенно неполными, так как они базируется только на информации, полученной от партнёров программы Crossref cited-by.
Просмотров за год: 6. Цитирований: 20 (РИНЦ).

Полнотекстовая версия журнала доступна также на сайте научной электронной библиотеки eLIBRARY.RU

Журнал входит в Перечень российских рецензируемых научных журналов, в которых должны быть опубликованы основные научные результаты диссертаций на соискание ученых степеней доктора и кандидата наук ВАК, группы специальностей: 01.01.00, 01.02.00.
 

Международная Междисциплинарная Конференция "Математика. Компьютер. Образование"

Международная Междисциплинарная Конференция МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ.

Журнал включен в базу данных Russian Science Citation Index (RSCI) на платформе Web of Science

Журнал индексируется в Scopus