Часто просматриваемые статьи

341. Аристов В.В., Ильин О.В.
     Описание быстрых процессов вторжения на основе кинетической модели
     Компьютерные исследования и моделирование, 2014, т. 6, № 5, с. 829-838

     В последние годы моделирование социальных, социо-биологических и исторических процессов получило большое развитие. В настоящей работе на основе кинетического подхода моделируются исторические процессы: агрессивное вторжение нацистской Германии в Польшу, Францию и СССР. Показано, что изучаемая система нелинейных уравнений полностью интегрируема: общее решение строится в виде квадратур. Вторжение (блицкриг) описывается краевой задачей Коши для двухэлементной кинетической модели с однородными по двум частям пространства начальными условиями. Решение данной задачи имеет вид бегущей волны, а скорость смещения линии фронта зависит от отношения начальных концентраций войск. Полученные оценки скорости распространения фронта согласуются с историческими фактами.

     Ключевые слова: кинетическая теория, модели агрессии.
     Просмотров за год: 4. Цитирований: 1 (РИНЦ).
342. Варшавский Л.Е.
     Использование методов теории управления для формирования рыночных структур
     Компьютерные исследования и моделирование, 2014, т. 6, № 5, с. 839-859

     В статье рассматриваются методы формирования рыночных структур при ориентации участников возникающих рынков на максимально возможные темпы роста, а также при ориентации их на максимизацию показателей экономической эффективности. Для первого случая разработан метод достижения желаемой структуры рынка, основанный на использовании принципов теории систем с переменной структурой. Для случая ориентации фирм на достижение максимума NPV рассматривается игровой подход к поддержанию конкурентной среды, основанный на эффективном методе расчета оптимальных по Нэшу–Курно и по Штакельбергу стратегий с помощью аппарата Z-преобразования.

     Ключевые слова: рыночные структуры, олигополистические рынки, системы с переменной структурой, динамические игры, оптимальные стратегии.
     Просмотров за год: 4. Цитирований: 4 (РИНЦ).
343. Озеров И.В., Осипов А.Н.
     Кинетическая модель репарации двунитевых разрывов ДНК в первичных фибробластах человека при действии редкоионизирующего излучения с различной мощностью дозы
     Компьютерные исследования и моделирование, 2015, т. 7, № 1, с. 159-176

     В настоящей работе представлены результаты кинетического моделирования индукции и репарации двунитевых разрывов ДНК, а также формирования скоплений (фокусов) фосфорилированного гистона H2AX ($\gamma$-H2AX) и белка Rad 51 в местах образования двунитевых разрывов, индуцированных воздействием редкоионизирующего излучения с различной мощностью и продолжительностью, в первичных фибробластах человека. Модель описывает основные механизмы репарации двунитевых разрывов: НГСК (негомологичное соединение концов) и ГР (гомологическая рекомбинация) и учитывает взаимодействия ряда белков (ДНК-ПКкс, ATM, Ku70/80, XRCC1, XRCC4, Rad51, ФРА и др.), участвующих в репарации двунитевых разрывов ДНК, на основе закона действующих масс и кинетики Михаэлиса-Ментен. Для тренировки и подтверждения статистической достоверности модели были использованы литературные данные по кинетике репарации двунитевых разрывов, а также данные по кинетике формирования и деградации фокусов белков репарации $\gamma$-H2AX и Rad51 в местах репарации двунитевых разрывов ДНК после облучения с различной мощностью дозы, полученные ранее нашим коллективом.

     Ключевые слова: двунитевые разрывы ДНК, репарация ДНК, кинетическое моделирование, редкоионизирующее излучение, мощность дозы излучения.
     Просмотров за год: 4. Цитирований: 3 (РИНЦ).
344. Зенков А.В.
     Отклонения от закона Бенфорда и распознавание авторских особенностей в текстах
     Компьютерные исследования и моделирование, 2015, т. 7, № 1, с. 197-201

     Исследовано распределение первой значащей цифры в числительных связных текстов. Обнаружено, что закон Бенфорда приближенно выполняется для них. Отклонения от закона Бенфорда являются статистически устойчивыми авторскими особенностями, позволяющими при некоторых условиях различить части текста с разным авторством.

     Ключевые слова: закон Бенфорда, статистическая проверка гипотез, критерий Манна–Уитни.
     Просмотров за год: 4. Цитирований: 6 (РИНЦ).
345. Левченко Е.А., Трифонов А.Ю., Шаповалов А.В.
     Квазиклассическое приближение для многомерного нелокального уравнения Фишера–Колмогорова–Петровского–Пискунова
     Компьютерные исследования и моделирование, 2015, т. 7, № 2, с. 205-219

     Для многомерного нелокального уравнения Фишера–Колмогорова–Петровского–Пискунова в классе траекторно-сосредоточенных функций построены квазиклассические асимптотики с точностью $O(D^{N/2})$, $N\geqslant3$. С помощью операторов симметрии получен счетный набор асимптотических решений исходного уравнения с точностью $O(D^{3/2})$. В явном виде построены асимптотические решения двумерного уравнения Фишера–Колмогорова–Петровского–Пискунова.

     Ключевые слова: нелокальное уравнение Фишера–Колмогорова–Петровского–Пискунова, асимптотическое решение, система Эйнштейна–Эренфеста.
     Просмотров за год: 4.
346. Колобов А.В., Кузнецов М.Б.
     Математическое моделирование роста малоинвазивной опухоли с учетом инактивации антиангиогенным препаратом фактора роста эндотелия сосудов
     Компьютерные исследования и моделирование, 2015, т. 7, № 2, с. 361-374

     Разработана математическая модель роста опухоли в ткани с учетом ангиогенеза и антиангиогенной терапии. В модели учтены как конвективные потоки в ткани, так и собственная подвижность клеток опухоли. Считается, что клетка начинает мигрировать, если концентрация питательного вещества падает ниже критического уровня, и возвращается в состояние пролиферации в области с высокой концентрацией пищи. Злокачественные клетки, находящиеся в состоянии метаболического стресса, вырабатывают фактор роста эндотелия сосудов (VEGF), стимулируя опухолевый ангиогенез, что увеличивает приток питательных веществ. В работе моделируется антиангиогенный препарат, который необратимо связывается с VEGF, переводя его в неактивное состояние. Проведено численное исследование влияния концентрации и эффективности антиангиогенного препарата на скорость роста и структуру опухоли. Показано, что сама по себе противоопухолевая антиангиогенная терапия способна замедлить рост малоинвазивной опухоли, но не способна его полностью остановить.

     Ключевые слова: математическое моделирование, опухоль, VEGF, антиангиогенная терапия.
     Просмотров за год: 4. Цитирований: 1 (РИНЦ).
347. Хоружников С.Э., Грудинин В.А., Садов О.Л., Шевель А.Е., Каирканов А.Б.
     Предварительное изучение передачи больших данных по компьютерной сети
     Компьютерные исследования и моделирование, 2015, т. 7, № 3, с. 421-427

     Передача больших данных по компьютерной сети — это важная и неотъемлемая операция в прошлом, настоящем и в любом обозримом будущем. Существует несколько методов передачи данных по глобальной компьютерной сети (Интернет) с помощью ряда инструментов. В этой статье рассматривается передача данных из одной точки Интернета в другую точку Интернета в основном на большие расстояния: многие тысячи километров. В статье представлен анализ нескольких бесплатных систем передачи больших данных. Подчеркиваются наиболее важные архитектурные особенности и предлагается идея использования технологии ПКС на базе протокола Openflow для улучшения процесса передачи данных по нескольким параллельным каналам связи.

     Ключевые слова: данные, Линукс, передача, ПКС, Openflow, сеть.
     Просмотров за год: 4.
348. Черемисина Е.Н., Сеннер А.Е.
     Применение ГИС ИНТЕГРО в задачах поиска месторождений нефти и газа
     Компьютерные исследования и моделирование, 2015, т. 7, № 3, с. 439-444

     В основу системы интегрированной интерпретации геофизических данных при изучении глубинного строения Земли положена система ГИС ИНТЕГРО, являющаяся геоинформационной системой функционирования разнообразных вычислительных и аналитических приложений при решении различных геологических задач. ГИС ИНТЕГРО включает в себя многообразные интерфейсы, позволяющие изменять форму представления данных (растр, вектор, регулярная и нерегулярная сеть наблюдений), блок преобразования картографических проекций, а также прикладные блоки, включающие блок интегрированного анализа данных и решения прогнозно-диагностических задач.

     Методический подход базируется на интеграции и комплексном анализе геофизических данных по региональным профилям, геофизических потенциальных полей и дополнительной геологической информации на изучаемую территорию.

     Аналитическое обеспечение включает пакеты трансформаций, фильтрации, статистической обработки полей, расчета характеристик, выделения линеаментов, решения прямых и обратных задач, интегрирования геоинформации.

     Технология и программно-аналитическое обеспечение апробировались при решении задач тектонического районирования в масштабах 1:200000, 1:1000000 в Якутии, Казахстане, Ростовской области, изучения глубинного строения по региональным профилям 1:ЕВ, 1-СБ, 2-СБ, 3-СБ и 2-ДВ, прогноза нефтегазоносности в районах Восточной Сибири, Бразилии.

     Ключевые слова: параллельные вычисления, ГРИД, геофизические исследования, обработка данных, 3D сетевая модель, GIS INTEGRO, ZondGeoStat.
     Просмотров за год: 4.
349. Богданов А.В., Ганкевич И.Г., Гайдучок В.Ю., Южанин Н.В.
     Запуск приложений на гибридном кластере
     Компьютерные исследования и моделирование, 2015, т. 7, № 3, с. 475-483

     Гибридный кластер подразумевает использование вычислительных ресурсов с различными архитектурами. Как правило, в таких системах используется CPU распространенной архитектуры (например, x86_64) и GPU (например, NVIDIA CUDA). Создание и эксплуатация подобного кластера требует определенного опыта: для того чтобы задействовать все вычислительные мощности такой системы и получить существенное ускорение на задачах, требуется учесть множество факторов. К таким факторам относятся как характеристики оборудования (например, особенности сетевой инфраструктуры, хранилища, архитектуры GPU), так и характеристики программного обеспечения (например, реализация MPI, библиотеки для работы с GPU). Таким образом для эффективных научных расчетов на подобных системах требуется помнить о характеристиках ускорителя (GPU), особенностях программного обеспечения, характеристиках задачи и о многих других факторах.

     В этой статье анализируются достоинства и недостатки гибридных вычислений. Будут приведены результаты запуска некоторых тестов и научных приложений, использующих GPGPU. Основное внимание уделено программных продуктах с открытым исходным кодом, которые поддерживают работу с GPGPU.

     Существует несколько подходов для организации гетерогенных вычислений. В данной статье мы рассмотрим приложения, использующие CUDA и OpenCL. CUDA довольно часто используется в подобных гибридных системах, в то время как переносимость OpenCL-приложений может сыграть решающую роль при выборе средства для разработки. Мы также уделим внимание системам с несколькими GPU, которые все чаще используются в рамках подобных кластеров. Вычисления проводились на гибридном кластере ресурсного центра «Вычислительный центр СПбГУ».

     Ключевые слова: GPGPU, высокопроизводительные вычисления, вычислительные кластеры, OpenFOAM, LINPACK, ViennaCL, CUDA, OpenCL.
     Просмотров за год: 4.
350. Минкин А.С., Книжник А.А., Потапкин Б.В.
     Реализация алгоритмов межатомного взаимодействия с использованием технологии OpenCL
     Компьютерные исследования и моделирование, 2015, т. 7, № 3, с. 549-558

     Моделирование углеродных наноструктур методом классической молекулярной динамики требует больших объемов вычислений. Один из способов повышения производительности соответствующих алгоритмов состоит в их адаптации для работы с SIMD-подобными архитектурами, в частности, с графическими процессорами. В данной работе рассмотрены особенности алгоритмов вычисления многочастичного взаимодействия на основе классических потенциалов Терсоффа и погруженного атома с использованием технологии OpenCL. Стандарт OpenCL позволяет обеспечить универсальность и переносимость алгоритмов и может быть эффективно использован для гетерогенных вычислений. В данной работе сделана оценка производительности OpenCL алгоритмов вычисления межатомного взаимодействия для систем на базе центральных и графических процессоров. Показано, что использование атомарных операций эффективно для вычисления потенциала Терсоффа и неэффективно в случае потенциала погруженного атома. Оценка производительности показывает значительное ускорение GPU реализации алгоритмов вычисления потенциалов межатомного взаимодействия по сравнению с соответствующими однопоточными алгоритмами.

     Ключевые слова: GPGPU, OpenCL, многочастичные потенциалы взаимодействия, потенциал Терсоффа, потенциал погруженного атома, атомарные операции.
     Просмотров за год: 4. Цитирований: 1 (РИНЦ).

• Общая информация
• Политика открытого доступа
• Публикационная этика
• Редакционная коллегия
• Авторский указатель
• Для авторов
• Для рецензентов
• Контакты
• Часто просматриваемые статьи
• Наиболее цитируемые статьи
• Подача статей ONLINE