Текущий выпуск Номер 5, 2024 Том 16

Все выпуски

Результаты поиска по 'Voronoi–Delaunay tessellation':
Найдено статей: 1
  1. Анашкина А.А., Есипова Н.Г., Кузнецов Е.Н., Туманян В.Г.
    Специфичность контактов в комплексах белок-ДНК
    Компьютерные исследования и моделирование, 2009, т. 1, № 3, с. 281-286

    С помощью разбиения Вороного–Делоне определены контакты между белками и нуклеиновыми кислотами в комплексах белок-ДНК. Показано, что приблизительно треть всех контактов составляют контакты с положительно заряженными аминокислотами Arg и Lys, 32,3 %. Ser и Thr дают в сумме следующий по величине вклад - 15 %. Asn образует 6 % контактов, также как и Gly. Вклад каждой из остальных аминокислот не превышает 5 %. Установлено, что статистически значимыми являются контакты типа Asp-G, Trp-C, Glu-C, Asp-C и His-T. Предложен общий механизм участия отрицательно заряженных остатков в специфических взаимодействиях белок-ДНК.

    Ключевые слова: разбиение Вороного–Делоне, комплексы белок-ДНК.
    Anashkina A.A., Esipova N.G., Kuznetsov E.N., Tumanyan V.G.
    Contact specificity in protein-DNA complexes
    Computer Research and Modeling, 2009, v. 1, no. 3, pp. 281-286

    In this work we investigated contacts between proteins and nucleic acids by Voronoi-Delaunay tessellation. About one third of all contacts are contacts between nucleotides and positively charged residues Arg and Lys, 32,3 %. Ser and Thr together take part in 15 % of contacts. Asn forms 6 % of contacts, as well as Gly. Contribution of each other residue type does not exceed 5 %. Statistically significant are contacts Asp-G, Trp-C, Glu-C, Asp-C and His-T. General mechanism of charged residues participation in specific protein-DNA interac-tions is suggested.

    Keywords: Voronoi–Delaunay tessellation, protein-DNA complexes.
    Просмотров за год: 2.

Журнал индексируется в Scopus

Полнотекстовая версия журнала доступна также на сайте научной электронной библиотеки eLIBRARY.RU

Журнал входит в систему  Российского индекса научного цитирования.

Журнал включен в базу данных Russian Science Citation Index (RSCI) на платформе Web of Science

Международная Междисциплинарная Конференция "Математика. Компьютер. Образование"

Международная Междисциплинарная Конференция МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ.

Copyright © 2009–2024 Институт компьютерных исследований