Определение промоторных и непромоторных последовательностей E.coli по профилям их электростатического потенциала

Темлякова Е.А., Сорокин А.А.
 pdf (209K)

В рамках данной работыбы ла продемонстрирована возможность использования характеристик профилей электростатического потенциала вдоль последовательностей ДНК для определения их функционального класса. Построенымо дели, позволяющие разделять промоторные и непромоторные последовательности (случайные бернуллиевские, кодирующие и псевдопромоторы) с точностью порядка 83–85%. Определены наиболее значимые участки для такого разделения, по-видимому играющие важную роль при ДНК-полимеразном узнавании.

Ключевые слова: электростатические свойства ДНК, поиск промоторов, PLS–DA, VIP-анализ
Цитата: Темлякова Е.А., Сорокин А.А. Определение промоторных и непромоторных последовательностей E.coli по профилям их электростатического потенциала // Компьютерные исследования и моделирование, 2015, т. 7, № 2, с. 347-359
Citation in English: Temlyakova E.A., Sorokin A.A. Detection of promoter and non-promoter E.coli sequences by analysis of their electrostatic profiles // Computer Research and Modeling, 2015, vol. 7, no. 2, pp. 347-359
URL: http://crm.ics.org.ru/journal/article/2269/

Полнотекстовая версия журнала доступна также на сайте научной электронной библиотеки eLIBRARY.RU

Журнал входит в систему  Российского индекса научного цитирования.

Журнал входит в Перечень российских рецензируемых научных журналов, в которых должны быть опубликованы основные научные результаты диссертаций на соискание ученых степеней доктора и кандидата наук ВАК, группы специальностей: 01.01.00, 01.02.00, 03.01.00, 03.02.00.
 

Международная Междисциплинарная Конференция "Математика. Компьютер. Образование"

Международная Междисциплинарная Конференция МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ.

Журнал включен в базу данных Russian Science Citation Index (RSCI) на платформе Web of Science

Copyright © 2009–2018 Институт компьютерных исследований