Все выпуски

[ Switch to English ]

Молекулярная модель образования комплекса ОСР с фикобилисомой

Зленко Д.В., Стадничук И.Н., Красильников П.М.
 pdf (3385K)  / Список литературы

Построена молекулярная модель взаимодействия фикобилисомыс ОСР, белком-тушителем, регулирующим передачу энергии от фикобилисом к фотосистемам в пигментном аппарате цианобактерий. Полученная модель не требует нарушения известной по рентгеноструктурным данным пространственной структуры взаимодействующих белков, а также позволяет удовлетворительно описать процесс переноса энергии к ОСР от фикобилисомы. Методом MM–PBSA рассчитана свободная энергия образования комплекса. Показано, что свободная энергия имеет величину не более нескольких десятков кДж/моль, что хорошо согласуется с наблюдаемой в эксперименте небольшой устойчивостью комплекса. Показано, что удельная свободная энергия взаимодействия рассматриваемых в модели весьма гидрофильных белков друг с другом примерно в два раза превышает удельную энергию их взаимодействия с водой, что свидетельствует о высокой комплементарности контактирующих белковых поверхностей и является сильным аргументом в пользу предложенной модели.

Ключевые слова: фикобилисома, OCP, комплексоообразование, молекулярное моделирование, свободная энергия, MM–PBSA
Цитата: Зленко Д.В., Стадничук И.Н., Красильников П.М. Молекулярная модель образования комплекса ОСР с фикобилисомой // Компьютерные исследования и моделирование, 2014, т. 6, № 5, с. 761-774
Citation in English: Zlenko D.V., Stadnichuk I.N., Krasilnikov P.M. Molecular model of OCP-phycobilisome complex formation // Computer Research and Modeling, 2014, vol. 6, no. 5, pp. 761-774
DOI: 10.20537/2076-7633-2014-6-5-761-774
URL: http://crm.ics.org.ru/journal/article/2193/
Creative Commons License Статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution-NoDerivs 3.0 Unported License.

Журнал индексируется в Scopus

Полнотекстовая версия журнала доступна также на сайте научной электронной библиотеки eLIBRARY.RU

Журнал входит в систему  Российского индекса научного цитирования.

Журнал включен в базу данных Russian Science Citation Index (RSCI) на платформе Web of Science

Международная Междисциплинарная Конференция "Математика. Компьютер. Образование"

Международная Междисциплинарная Конференция МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ.

Copyright © 2009–2024 Институт компьютерных исследований