Все выпуски

[ Switch to English ]

Исследование механических свойств C-кадгерина методом молекулярной динамики

Лихачев И.В., Галзитская О.В., Балабаев Н.К.
 pdf (640K)  / Список литературы

В настоящей работе исследуется механическая стабильность белка клеточной адгезии, кадгерина, методом молекулярной динамики с использованием явной модели растворителя. Было проведено моделирование разворачивания белка за концы с постоянной скоростью для апоформы белка и при наличии в ней ионов разных типов (Ca2+, Mg2+, Na+, K+). Было выполнено по 8 независимых вычислительных экспериментов для каждой формы белка и показано, что одновалентные ионы меньше стабилизируют структуру, чем двухвалентные при механическом разворачивании молекулы кадгерина за концы. Модельная система из двух аминокислот и иона металла между ними в опытах по растяжению демонстрирует свойства аналогичные поведению кадгерина: cистемы с ионами калия и натрия обладают меньшей механической стабильностью на внешнее силовое воздействие в сравнении с системами с кальцием и магнием.

Ключевые слова: С-кадгерин, молекулярная динамика, двухвалентные и одновалентные ионы
Цитата: Лихачев И.В., Галзитская О.В., Балабаев Н.К. Исследование механических свойств C-кадгерина методом молекулярной динамики // Компьютерные исследования и моделирование, 2013, т. 5, № 4, с. 727-735
Citation in English: Lihachev I.V., Galzitskaya O.V., Balabaev N.K. Investigation of C-Cadherin mechanical properties by Molecular Dynamics // Computer Research and Modeling, 2013, vol. 5, no. 4, pp. 727-735
DOI: 10.20537/2076-7633-2013-5-4-727-735
URL: http://crm.ics.org.ru/journal/article/2078/
Creative Commons License Статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution-NoDerivs 3.0 Unported License.
Просмотров за год: 5.

Журнал индексируется в Scopus

Полнотекстовая версия журнала доступна также на сайте научной электронной библиотеки eLIBRARY.RU

Журнал входит в систему  Российского индекса научного цитирования.

Журнал включен в базу данных Russian Science Citation Index (RSCI) на платформе Web of Science

Международная Междисциплинарная Конференция "Математика. Компьютер. Образование"

Международная Междисциплинарная Конференция МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ.

Copyright © 2009–2024 Институт компьютерных исследований