Распределение мононуклеотидных повторов в бактериальных хромосомах: A/T-треки преобладают над G/C-треками

 pdf (6460K)

В данной работе исследовано распределение мононуклеотидных треков разной длины в 342 хромосомах эубактерий и 69 хромосомах архей. Несмотря на то, что число анализируемых повторов проявляет зависимость от нуклеотидного состава, в 73 % случаев (301 хромосома, в том числе и в 90 хромосомах, обогащенных GC-парами) было обнаружено преобладание poly(dA)n- и poly(dT)n-треков над poly(dG)n- и poly(dC)n-треками. В природных ДНК число А/Т-треков чаще всего в 2 раза выше, чем в случайных нуклеотидных последовательностях с аналогичным AT/GC-составом и длиной. Обсуждаются возможные причины появления подобной асимметрии в распределениях.

Ключевые слова: мононуклеотидные повторы, A/T-треки, G/C-треки
Цитата: Киселев С.С., Комаров В.М., Масулис И.С., Озолинь О.Н. Распределение мононуклеотидных повторов в бактериальных хромосомах: A/T-треки преобладают над G/C-треками // Компьютерные исследования и моделирование, 2010, т. 2, № 2, с. 183-187
Citation in English: Kisselev S.S., Komarov V.M., Masulis I.S., Ozoline O.N. Distribution of mononucleotide repeats in bacterial chromosomes: A/T-tracts dominate on G/C-tracts // Computer Research and Modeling, 2010, vol. 2, no. 2, pp. 183-187

Полнотекстовая версия журнала доступна также на сайте научной электронной библиотеки eLIBRARY.RU

Журнал входит в Перечень российских рецензируемых научных журналов, в которых должны быть опубликованы основные научные результаты диссертаций на соискание ученых степеней доктора и кандидата наук ВАК, группы специальностей: 01.01.00, 01.02.00, 03.01.00, 03.02.00.
 

Международная Междисциплинарная Конференция "Математика. Компьютер. Образование"

Международная Междисциплинарная Конференция МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ.

Журнал включен в базу данных Russian Science Citation Index (RSCI) на платформе Web of Science