Исследование механических свойств иммуноглобулинсвязывающих доменов белков L и G методом молекулярной динамики

 pdf (495K)

Механическое разворачивание под действием внешних сил двух похожих по пространственной структуре, но отличающихся по аминокислотной последовательности иммуноглобулинсвязывающих доменов белков L и G исследуется методом молекулярной динамики с использованием явной модели растворителя. Рассчитаны механические характеристики этих белков. Показано, что на пути механического разворачивания обоих белков появляются промежуточные состояния. Проведенные расчеты выявили три существенно различающихся пути механического разворачивания белков L и G.

Ключевые слова: молекулярная динамика, механическое разворачивание, контакты между элементами вторичной структуры
Цитата: Компьютерные исследования и моделирование, 2010, т. 2, № 1, с. 73-81

Investigation of the mechanical properties of immunoglobulinbinding domains of proteins L and G using the molecular dynamics simulations

Mechanical unfolding of two identical in structure but differ in their amino acid sequences immunoglobulinbinding domains of proteins L and G under the action of external forces have been investigating  using the method of molecular dynamics with explicit model of solvent. Mechanical characteristics of these proteins have been calculated. It has been shown that in the way of the mechanical unfolding of both proteins appear intermediate states. Calculations revealed three significantly different ways of mechanical unfolding of proteins L and G.

Citation in English: Computer Research and Modeling, 2010, vol. 2, no. 1, pp. 73-81

Полнотекстовая версия журнала доступна также на сайте научной электронной библиотеки eLIBRARY.RU

Журнал входит в Перечень российских рецензируемых научных журналов, в которых должны быть опубликованы основные научные результаты диссертаций на соискание ученых степеней доктора и кандидата наук ВАК.

Международная Междисциплинарная Конференция

Международная Междисциплинарная Конференция МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ.