Математические методы анализа электрофоретических картин расщепления ДНК

 pdf (1268K)

При анализе картин электрофореза высокого разрешения необходимо учитывать позиционный эффект — зависимость интенсивности полосы от ее положения в геле. Оценки зависимости относительных частот разрывов межнуклеотидных связей от типа нуклеотидов, получаемые при анализе картин расщепления фрагментов молекул ДНК, производились при помощи методов: а) линейно скользящего среднего; б) описания функции позиционной зависимости полиномом третьей степени. Анализ расщепления последовательностей ДНК при помощи линейно скользящего среднего позволил установить относительные частоты разрывов связей во всех 16 динуклеотидах, встречающихся в последовательности ДНК.

Ключевые слова: электрофорез, расщепление ДНК, физическое картирование ДНК
Цитата: Головкин М.В., Нечипуренко Д.Ю., Ильичева И.А., Панченко Л.А., Полозов Р.В., Гроховский С.Л., Нечипуренко Ю.Д. Математические методы анализа электрофоретических картин расщепления ДНК // Компьютерные исследования и моделирование, 2009, т. 1, № 3, с. 287-295
Citation in English: Golovkin M.V., Nechipurenko D.Y., Il’icheva I.A., Panchenko L.A., Polozov R.V., Grokhovsky S.L., Nechipurenko Y.D. Calculational methods for electrophoretic cleavage pattern analysis of DNA // Computer Research and Modeling, 2009, vol. 1, no. 3, pp. 287-295
Creative Commons License
Статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution-NoDerivs 3.0 Unported License.

Полнотекстовая версия журнала доступна также на сайте научной электронной библиотеки eLIBRARY.RU

Журнал входит в Перечень российских рецензируемых научных журналов, в которых должны быть опубликованы основные научные результаты диссертаций на соискание ученых степеней доктора и кандидата наук ВАК, группы специальностей: 01.01.00, 01.02.00.
 

Международная Междисциплинарная Конференция "Математика. Компьютер. Образование"

Международная Междисциплинарная Конференция МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ.

Журнал включен в базу данных Russian Science Citation Index (RSCI) на платформе Web of Science

Журнал индексируется в Scopus