Математическое моделирование роста карциномы при динамическом изменении фенотипа клеток

 pdf (24733K)  / Аннотация

Список литературы:

  1. Д. А. Брацун, А. П. Захаров, Л. М. Письмен. Многоуровневое математическое моделирование возникновения и роста опухоли в ткани эпителия // Компьютерные исследования и моделирование. — 2014. — Т. 6, № 4. — С. 585–604. — DOI: 10.20537/2076-7633-2014-6-4-585-604
    • D. A. Bratsun, A. P. Zakharov, L. M. Pismen. Multiscale mathematical modeling occurrence and growth of a tumour in an epithelial tissue // Computer Research and Modeling. — 2014. — V. 6, no. 4. — P. 585–604. — in Russian. — DOI: 10.20537/2076-7633-2014-6-4-585-604
  2. А. П. Захаров, Д. А. Брацун. Синхронизация циркадианных ритмов в масштабах гена, клетки и всего организма // Компьютерные исследования и моделирование. — 2013. — Т. 5, № 2. — С. 255–270. — DOI: 10.20537/2076-7633-2013-5-2-255-270
    • A. P. Zakharov, D. A. Bratsun. Synchronization of circadian rhythms in the scale of a gene, a cell and a whole organism // Computer Research and Modelling. — 2013. — V. 5, no. 2. — P. 255–270. — in Russian. — DOI: 10.20537/2076-7633-2013-5-2-255-270
  3. М. М. Калиничева, В. В. Котин, Е. М. Писаренко. Моделирование роста опухоли эпителиальных тканей с использованием алгоритмов клеточных автоматов // Альманах клинической медицины. — 2008. — Т. 17, № 1. — С. 179–182.
    • M. M. Kalinicheva, V. V. Kotin, E. M. Pisarenko. Modeling of tumor growth of epithelial tissues using cellular automata algorithms // Almanac of clinical medicine. — 2008. — V. 17, no. 1. — P. 179–182. — in Russian.
  4. А. В. Колобов, А. А. Полежаев. Влияние случайной подвижности злокачественных клеток на устойчивость фронта опухоли // Компьютерные исследования и моделирование. — 2009. — Т. 1, № 2. — С. 225–232. — DOI: 10.20537/2076-7633-2009-1-2-225-232
    • A. V. Kolobov, A. A. Polezhaev. Influence of random malignant cell motility on growing tumor front stability // Computer Research and Modelling. — 2009. — V. 1, no. 2. — P. 225–232. — in Russian. — DOI: 10.20537/2076-7633-2009-1-2-225-232
  5. Н. В. Крахмаль, М. В. Завьялова, Е. В. Денисов, С. В. Вторушин, В. М. Перельмутер. Инвазия опухолевых эпителиальных клеток: механизмы и проявления // Acta Naturae. — 2015. — Т. 7, № 2. — С. 18–31.
    • N. V. Krakhmal, M. V. Zavyalova, E. V. Denisov, S. V. Vtorushin, V. M. Perelmuter. Cancer Invasion: Patterns and Mechanisms // Acta Naturae. — 2015. — V. 7, no. 2. — P. 18–31. — in Russian.
  6. М. Б. Кузнецов, А. В. Колобов. Исследование влияния антиангиогенной монотерапии на прогрессию гетерогенной опухоли с помощью методов математического моделирования // Компьютерные исследования и моделирование. — 2017. — Т. 9, № 3. — С. 487–501. — DOI: 10.20537/2076-7633-2017-9-3-487-501
    • M. B. Kuznetsov, A. V. Kolobov. Mathematical investigation of antiangiogenic monotherapy effect on heterogeneous tumor progression // Computer Research and Modelling. — 2017. — V. 9, no. 3. — P. 487–501. — in Russian. — DOI: 10.20537/2076-7633-2017-9-3-487-501.
  7. А. Г. Кучумов. Математическое моделирование и биомеханический подход к описанию развития, диагностики и лечения онкологических заболеваний // Российский журнал биомеханики. — 2010. — Т. 14, № 4. — С. 42–69.
    • A. G. Kuchumov. Mathematical modelling and biomechanical approach to describe the development, the diagnostics, and the treatment of oncological diseases // Russian Journal of Biomechanics. — 2010. — V. 14, no. 4. — P. 42–69. — in Russian.
  8. T. Alarcon, H. M. Byrne, P. K. Maini. A cellular automaton model for tumour growth in inhomogeneous environment // J. Theor. Biol. — 2003. — V. 225. — P. 257–274. — DOI: 10.1016/S0022-5193(03)00244-3. — MathSciNet: MR2077392.
  9. C. Brakebusch, R. Fässler. β1 integrin function in vivo: Adhesion, migration and more // Cancer and Metastasis Reviews. — 2005. — V. 24, no. 3. — P. 403–411. — DOI: 10.1007/s10555-005-5132-5.
  10. D. A. Bratsun, I. V. Krasnyakov, L. M. Pismen. Chemo-elastic modeling of invasive carcinoma development accompanied by oncogenic epithelial-mesenchymal transition // AIP Conference Proceedings. — 2017. — V. 1882. — 020008. — DOI: 10.1063/1.5001587. — MathSciNet: MR3705957.
  11. D. A. Bratsun, D. V. Merkuriev, A. P. Zakharov, L. M. Pismen. Multiscale modeling of tumor growth induced by circadian rhythm disruption in epithelial tissue // J. Biol. Phys. — 2016. — V. 42, no. 1. — P. 107–132. — DOI: 10.1007/s10867-015-9395-y.
  12. D. A. Bratsun, A. P. Zakharov, L. M. Pismen. Chemo-mechanical modeling of tumor growth in elastic epithelial tissue // AIP Conference Proceedings. — 2016. — V. 1760. — 020007. — DOI: 10.1063/1.4960226.
  13. V. Cristini, J. Lowengrub. Multiscale modeling of cancer: An integrated experimental and mathematical modeling approach. — Cambridge University Press, 2010. — P. 278.
  14. T. S. Deisboeck, G. S. Stamatakos. Multiscale cancer modeling. — CRC Press, 2010. — P. 484.
  15. T. S. Deisboeck, Z. Wang, P. Macklin, V. Cristini. Multiscale cancer modeling // Annu. Rev. Biomed. Eng. — 2011. — V. 13. — P. 127–155. — DOI: 10.1146/annurev-bioeng-071910-124729. — MathSciNet: MR2504081.
  16. E. V. Denisov, T. S. Geraschenko, M. V. Zavyalova, N. V. Litviakov, M. M. Tsyganov, E. V. Kaigorodova, E. M. Slonimskaya, J. Kzhyshkowska, N. V. Cherdyntseva, V. M. Perelmuter. Invasive and drug resistant expression profile of different morphological structures of breast tumors // Neoplasma. — 2015. — V. 62, no. 3. — P. 405–411. — DOI: 10.4149/neo_2015_041.
  17. E. V. Denisov, N. A. Skryabin, T. S. Gerashchenko, L. A. Tashireva, J. Wilhelm, M. A. Buldakov, A. A. Sleptcov, I. N. Lebedev, S. V. Vtorushin, M. V. Zavyalova, N. V. Cherdyntseva, V. M. Perelmuter. Clinically relevant morphological structures in breast cancer represent transcriptionally distinct tumor cell populations with varied degrees of epithelial-mesenchymal transition and CD44+CD24- stemness // Oncotarget. — 2017. — V. 8, no. 37. — P. 61163–61180. — DOI: 10.18632/oncotarget.18022.
  18. A. Fasano, A. Bertuzzi, A. Gendolfi. Mathematical modelling of tumour growth and treatment // Complex System in Biomedicine. — 2006. — V. 26. — P. 71–108. — DOI: 10.1007/88-470-0396-2_3. — MathSciNet: MR2487998.
  19. H. Honda, T. Nagai, M. Tanemura. Two different mechanisms of planar cell intercalation leading to tissue elongation // Developmental Dynamics. — 2008. — V. 237. — P. 1826–1836. — DOI: 10.1002/dvdy.21609.
  20. Y. Kim, M. A. Stolarska, H. G. Othmer. A hybrid model for tumour spheroid growth in vitro I: Theoretical development and early results // Math. Mod. Meth. Appl. Sci. — 2007. — V. 17. — P. 1773–1798. — DOI: 10.1142/S0218202507002479. — MathSciNet: MR2362764.
  21. S. Lamouille, J. Xu, R. Derynck. Molecular mechanisms of epithelial-mesenchymal transition // Nat. Rev. Mol. Cell Biol. — 2014. — V. 15, no. 3. — P. 178–196. — DOI: 10.1038/nrm3758.
  22. A. Lesne, N. Foray, G. Cathala, T. Forne, H. Wong, J.-M. Victor. Chromatin fiber allostery and the epigenetic code // J. Phys. Condens. Matter. — 2015. — V. 27. — 064114. — DOI: 10.1088/0953-8984/27/6/064114. — ads: 2015JPCM...27f4114L.
  23. A. Monteagudo, J. Santos. A Cellular Automaton Model for Tumor Growth Simulation / 6th International Conference on PACBB. AISC. — 2012. — V. 154. — P. 147–155.
  24. I. Ruben, R.-R. Reinaldo, V.-R. Fernando, R.-T. Ariel, C. C. Riberio, A. Conci. Tumor growth modelling by cellular automata // Mathematics and Mechanics Complex Systems. — 2017. — V. 5, no. 3–4. — P. 239–259. — MathSciNet: MR3740254.
  25. M. Salm, L. M. Pismen. Chemical and mechanical signaling in epithelial spreading // Phys. Biol. — 2012. — V. 9, no. 2. — P. 026009–026023. — DOI: 10.1088/1478-3975/9/2/026009. — ads: 2012PhBio...9b6009S.
  26. G. Sciumè, S. Shelton, W. G. Gray, C. T. Miller, F. Hussain, M. Ferrari, P. Decuzzi, B. A. Schrefler. A multiphase model for three-dimensional tumor growth // New J. Phys. — 2013. — V. 15. — 015005. — DOI: 10.1088/1367-2630/15/1/015005. — MathSciNet: MR3128031.
  27. D. P. Tabassum, K. Polyak. Tumorigenesis: it takes a village // Nat. Rev. Cancer. — 2015. — V. 8. — P. 473–483. — DOI: 10.1038/nrc3971.
  28. F. van Zijl, G. Krupitza, W. Mikulits. Initial steps of metastasis: Cell invasion and endothelial transmigration // Mutat. Res. — 2011. — V. 728. — P. 23–34. — DOI: 10.1016/j.mrrev.2011.05.002.
  29. I. Viktorinova, L. M. Pismen, B. Aigouy, C. Dahmann. The role of signal relay in collective cell polarization // J. R. Soc. Interface. — 2011. — V. 8. — P. 1059–1063. — DOI: 10.1098/rsif.2011.0117.
  30. G. F. Weber. Molecular Mechanisms of Cancer. — Springer, 2007. — P. 645.
  31. A. P. Zakharov, L. M. Pismen. Reshaping nemato-elastic sheets // Eur. Phys. J. E Soft Matter. — 2015. — V. 38, no. 7. — P. 75.

Полнотекстовая версия журнала доступна также на сайте научной электронной библиотеки eLIBRARY.RU

Журнал входит в Перечень российских рецензируемых научных журналов, в которых должны быть опубликованы основные научные результаты диссертаций на соискание ученых степеней доктора и кандидата наук ВАК, группы специальностей: 01.01.00, 01.02.00.
 

Международная Междисциплинарная Конференция "Математика. Компьютер. Образование"

Международная Междисциплинарная Конференция МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ.

Журнал включен в базу данных Russian Science Citation Index (RSCI) на платформе Web of Science

Журнал индексируется в Scopus