Все выпуски

Динамические свойства полинуклеотидной цепи, состоящей из двух неодинаковых однородных последовательностей, разделенных границей

 pdf (394K)  / Аннотация

Список литературы:

  1. Р. Буллаф, Ф. Кодри. Солитоны. — М: Мир, 1983. — 408 с.
  2. Л. В. Якушевич. Нелинейная физика ДНК. — Ижевск: НИЦ РХД, 2007. — 252 с.
  3. Л. В. Якушевич, А. В. Савин, Л. И. Маневич. Нелинейные волны в молекулах ДНК, содержащих границу между двумя однородными областями // Компьютерные исследования и моделирование. — 2009. — Т. 1. — С. 209–215. — DOI: 10.20537/2076-7633-2009-1-2-209-215.
  4. J. D. Bashford. Salerno’s model of DNA reanalysed: could solitons have biological significance? // J.Biol.Phys. — 2006. — V. 32. — P. 27–47. — DOI: 10.1007/s10867-006-2719-1.
  5. S. P. Bell, A. Dutta. DNA replication in eukaryotic cells // Annu. Rev. Biochem. — 2002. — V. 71. — P. 333–374. — DOI: 10.1146/annurev.biochem.71.110601.135425.
  6. M. Cadoni, R. De Leo, S. Demelio. Soliton Propagation in Homogeneous and Inhomogeneous Models for DNA Torsion Dynamics // J. Nonlinear Math. Phys. — 1995. — V. 18, no. 2. — P. 287–319. — DOI: 10.1142/S1402925111001544. — MathSciNet: MR2827504.
  7. G. M. Cheetham, T. A. Steitz. Insights into transcription: structure and function of single-subunit DNA-dependent RNA polymerases // Curr. Opin. Struct. Biol. — 2000. — V. 10. — P. 117–123. — DOI: 10.1016/S0959-440X(99)00058-5.
  8. S. Cuenda, A. Sanchez. Disorder and fluctuations in nonlinear excitations in DNA // Fluctuation and Noise Letters. — 2004. — V. 4. — 571 p. — DOI: 10.1142/S0219477504002099.
  9. S. Cuenda, A. Sanchez. Nonlinear excitations in DNA: Aperiodic model versus actual genome sequences // Phys. Rev. E. — 2004. — V. 70. — 05193. — DOI: 10.1103/PhysRevE.70.051903.
  10. F. Dominguez-Adame, A. Sanchez, Yu. S. Kivshar. Soliton pinning by long-range order in aperiodic systems // Phys. Rev. E. — 1995. — V. 52. — 2183. — DOI: 10.1103/PhysRevE.52.R2183.
  11. S. W. Englander, N. R. Kallenbach, A. J. Heeger, J. A. Krumhansl, S. Litwin. Nature of the open state in long polynucleotide double helices: Possibility of soliton excitations // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 1980. — V. 77. — P. 7222–7226. — DOI: 10.1073/pnas.77.12.7222. — ads: 1980PNAS...77.7222E.
  12. A. Ghosh, M. A. Bansal. A glossary of DNA structures from A to Z // Acta. Crystallogr. D. Biol. Crystallogr. — 2003. — V. 59. — P. 602–626. — DOI: 10.1107/S0907444903003251.
  13. P. H. von Hippel. DNA-Protein Interactions to the Macromolecular Machines of Gene Expression // Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. — 2007. — V. 36. — P. 79–105. — DOI: 10.1146/annurev.biophys.34.040204.144521.
  14. Z. Kelman, M. O’Donnell. DNA polymerase III holoenzyme: structure and function of a chromosomal replicating machine // Annu. Rev. Biochem. — 1995. — V. 64. — P. 171–200. — DOI: 10.1146/annurev.bi.64.070195.001131.
  15. H. Razqallah. DNA-damage repair; the good, the bad, and the ugly // EMBO J. — 2008. — V. 27. — P. 589–605. — DOI: 10.1038/emboj.2008.15.
  16. M. Salerno. Dynamical properties of DNA promoters // Phys. Lett. A. — 1992. — V. 167. — P. 49–53. — DOI: 10.1016/0375-9601(92)90624-U. — ads: 1992PhLA..167...49S.
  17. M. Salerno. Nonlinear dynamics of plasmid pB R322 promoters / Nonlinear Excitations in Biomolecules. — Berlin: Springer-Verlag, 1995. — P. 147–153. — M. Peyrard (ed.).
  18. M. Salerno, Yu. S. Kivshar. DNA promoters and nonlinear dynamics // Phys. Lett. A. — 1994. — V. 193. — P. 263–266. — DOI: 10.1016/0375-9601(94)90594-0. — ads: 1994PhLA..193..263S.
  19. J. D. Watson, F. H. Crick. Molecular structure of nucleic acids; a structure for deoxyribose nucleic acid // Nature. — 1953. — V. 171. — P. 737–738. — DOI: 10.1038/171737a0. — ads: 1953Natur.171..737W.
  20. L. V. Yakushevich. The effect of damping, external fields and inhomogeneity on the nonlinear dynamics of biopolymers // Studia biophys. — 1987. — V. 121. — P. 201–207.
  21. L. V. Yakushevich. DNA dynamics: a new model // Phys. Lett. A. — 1989. — V. 136. — P. 413–417. — DOI: 10.1016/0375-9601(89)90425-8. — ads: 1989PhLA..136..413Y.
  22. L. V. Yakushevich, L. V. Krasnobaeva. A new approach to studies of non-linear dynamics of kinks activated in inhomogeneous polynucleotide chains // International Journal of Nonlinear Mechanics. — 2008. — V. 43. — P. 1074–1081. — DOI: 10.1016/j.ijnonlinmec.2008.05.003. — ads: 2008IJNLM..43.1074Y.

Журнал индексируется в Scopus

Полнотекстовая версия журнала доступна также на сайте научной электронной библиотеки eLIBRARY.RU

Журнал включен в базу данных Russian Science Citation Index (RSCI) на платформе Web of Science

Международная Междисциплинарная Конференция "Математика. Компьютер. Образование"

Международная Междисциплинарная Конференция МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ.