Все выпуски

Сопряжение различных методов компьютерного моделирования в комплексной модели фотосинтетической мембраны

 pdf (1028K)  / Аннотация

Список литературы:

  1. А. М. Абатурова, И. Б. Коваленко, Г. Ю. Ризниченко, А. Б. Рубин. Исследование образования комплекса флаводоксина и фотосистемы 1 методами прямого многочастичного компьютерного моделирования // Компьютерные исследования и моделирование. — 2009. — Т. 1. — С. 85–91. — DOI: 10.20537/2076-7633-2009-1-1-85-91.
  2. А. В. Вершубский, В. И. Приклонский, А. Н. Тихонов. Математическая модель электронного и протонного транспорта в фотосинтетических системах оксигенного типа // Росcийский химический журнал. — 2007. — Т. LI.
  3. И. Б. Коваленко, А. М. Абатурова, Г. Ю. Ризниченко, А. Б. Рубин. Новый метод компьютерного моделирования образования белок-белковых комплексов // Доклады Академии наук. — 2009. — Т. 427. — С. 696–698.
  4. Г. В. Лебедева, Н. Е. Беляева, Г. Ю. Ризниченко и др. Кинетическая модель фотосистемы II высших растений // Журнал физической химии. — 2000. — Т. 74. — С. 1874–1883.
  5. A.T. Мокроносов, В.Ф. Гавриленко. Фотосинтез. Физиолого-экологические и биохимические аспекты. — Москва: Изд-во МГУ, 1992.
  6. Г. Ю. Ризниченко, Н. Е. Беляева, И. Б. Коваленко, А. Б. Рубин. Математическое и компьютерное моделирование первичных процессов фотосинтеза // Биофизика. — 2009. — Т. 54. — С. 16–33.
  7. А. Н. Тихонов, Л. А. Блюменфельд. Концентрация водородных ионов в в субклеточных частицах: физический смысл и методы определения // Биофизика. — 1985. — Т. 30. — С. 527–537.
  8. Д. М. Устинин, И. Б. Коваленко, Е. А. Грачев и др. Метод прямого многочастичного компьютерного моделирования фотосинтетической электронно-транспортной цепи / Динамические модели процессов в клетках и субклеточных наноструктурах. — 2010. — С. 241–262.
  9. P. A. Albertsson. A quantitative model of the domain structure of the photosynthetic membrane // Trends in Plant Science. — 2001. — V. 6. — P. 349–354. — DOI: 10.1016/S1360-1385(01)02021-0.
  10. W. Chow, A. B. Hope. Kinetics of reactions around the cytochrome bf complex studied in intact leaf disks // Photosynthetic Research. — 2004. — V. 81. — P. 153–163. — DOI: 10.1023/B:PRES.0000035027.02655.8c.
  11. F. De Rienzo, R. R. Gabdoulline, M. C. Menziani, et al. Electrostatic analysis and Brownian dynamics simulation of the association of plastocyanin and cytochrome f // Biophysical Journal. — 2001. — V. 81. — P. 3090–3104. — DOI: 10.1016/S0006-3495(01)75947-4. — ads: 2001BpJ....81.3090D.
  12. E. L. Gross. Plastocyanin: structure, location, diffusion and electron transfer mechanisms / Biochemistry and Molecular Biology of Plants. — Kluwer Academic Publishers, 1996. — P. 413–429. — edited by R. Jones.
  13. E. L. Gross, Jr. D. C. Pearson. Brownian Dynamics Simulations of the Interaction of Chlamydomonas Cytochrome f with Plastocyanin and Cytochrome c6 // Biophysical Journal. — 2003. — V. 85. — P. 2055–2068. — DOI: 10.1016/S0006-3495(03)74633-5. — ads: 2003BpJ....85.2055G.
  14. A. B. Hope. The chloroplast cytochrome bf complex: a critical focus on function // Biochim. Biophys. Acta. — 1993. — V. 1143. — P. 1–22. — DOI: 10.1016/0005-2728(93)90210-7.
  15. A. B. Hope. Electron transfers amongst cytochrome f, plastocyanin and photosystem I: kinetics and mechanisms // Biochim. Biophys. Acta. — 2000. — V. 1456. — P. 5–26. — DOI: 10.1016/S0005-2728(99)00101-2.
  16. M. Mehta, V. Sarafis, C. Critchley. Thylakoid membrane architecture // Australian Journal of Plant Physiology. — 1999. — V. 26. — P. 709–716. — DOI: 10.1071/PP99068.
  17. D. C. Pearson, E. L. Gross. Brownian dynamics study of the interaction between plastocyanin and cytochrome f // Biophysical Journal. — 1998. — V. 75. — P. 2698–2711. — DOI: 10.1016/S0006-3495(98)77714-8. — ads: 1998BpJ....75.2698P.
  18. G. Y. Riznichenko, I. B. Kovalenko, A. M. Abaturova, et al. New direct dynamic models of protein interactions coupled to photosynthetic electron transport reactions // Biophysical Reviews. — 2010. — V. 2. — P. 101–110. — DOI: 10.1007/s12551-010-0033-4.
  19. A. B. Rubin, G. Y. Riznichenko. Models of primary processes in a photosynthetic membrane // Advances in Photosynthesis and respiration. — 2009. — V. 29. — P. 151–176. — DOI: 10.1007/978-1-4020-9237-4_7.
  20. A. Stirbet, Govindjee, B. J. Strasser, R. J. Strasser. Chlorophylla Fluorescence Induction in Higher Plants: Modelling and Numerical Simulation // Journal of Theoretical Biology. — 1998. — V. 193. — P. 131–151. — DOI: 10.1006/jtbi.1998.0692.
  21. M. Ubbink, M. Ejdeback, G. B. Karlsson, D. S. Bendall. The structure of the complex of plastocyanin and cytochrome f, determined by paramagnetic NMR and restrained rigid-body molecular dynamics // Structure. — 1998. — V. 6. — P. 323–335. — DOI: 10.1016/S0969-2126(98)00035-5.
  22. G. M. Ullmann, E.-W. Knapp, N. M. Kostic. Computational Simulation and Analysis of Dynamic Association between Plastocyanin and Cytochrome f. Consequences for the Electron-Transfer Reaction // Journal of American Chemical Society. — 1997. — V. 119. — P. 42–52. — DOI: 10.1021/ja962237u.

Журнал индексируется в Scopus

Полнотекстовая версия журнала доступна также на сайте научной электронной библиотеки eLIBRARY.RU

Журнал включен в базу данных Russian Science Citation Index (RSCI) на платформе Web of Science

Международная Междисциплинарная Конференция "Математика. Компьютер. Образование"

Международная Междисциплинарная Конференция МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ.