Все выпуски

Анализ динамических режимов взаимодействующих синтетических генетических репрессиляторов

 pdf (710K)  / Аннотация

Список литературы:

  1. M. Atkinson, M. Savageau, J. Myers, A. Ninfa. Development of genetic circuitry exhibiting toggle switch or oscillatory behavior in Escherichia coli // Cell. — 2003. — V. 113. — P. 597–607. — DOI: 10.1016/S0092-8674(03)00346-5.
  2. T. Danino, O. Mondrag´on-Palomino, L. Tsimring, J. Hasty. A synchronized quorum of genetic clocks // Nature. — 2010. — V. 463. — P. 326–330. — DOI: 10.1038/nature08753. — ads: 2010Natur.463..326D.
  3. J. Dockery, J. Keener. A mathematical model for quorum sensing in Pseudomonas aeruginosa // Bull. Math. Biol. — 2001. — V. 63. — P. 95–116. — DOI: 10.1006/bulm.2000.0205.
  4. E. Doedel. AUTO: A program for the automatic bifurcation analysis of autonomous systems / Cong. Num. — Proc. 10th Manitoba Conf. on Num. Math. and Comp. — Winnipeg, Canada: University of Manitoba, 1981. — V. 30. — P. 265–284. — MathSciNet: MR0635945.
  5. M. Elowitz, S. Leibler. A synthetic oscillatory network of transcriptional regulators // Nature. — 2000. — V. 403. — P. 335–338. — DOI: 10.1038/35002125. — ads: 2000Natur.403..335E.
  6. M. Feigenbaum. Quantitative universality for a class of nonlinear transformations // J. Stat. Phys. — 1978. — V. 19, no. 1. — P. 25–52. — DOI: 10.1007/BF01020332. — MathSciNet: MR0501179. — ads: 1978JSP....19...25F.
  7. J. Garc´ıa-Ojalvo, M. Elowitz, S. Strogatz. Modeling a synthetic multicellular clock: Repressilators coupled by quorum sensing // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. — 2004. — V. 101. — P. 10955. — MathSciNet: MR2099983. — ads: 2004PNAS..10110955G.
  8. T. Gardner, C. Cantor, J. Collins. Construction of a genetic toggle switch in Escherichia coli // Nature. — 2000. — V. 403. — P. 339–342. — DOI: 10.1038/35002131. — ads: 2000Natur.403..339G.
  9. D. McMillen, N. Kopell, J. Hasty, J. Collins. Synchronizing genetic relaxation oscillators by intercell signalling // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. — 2002. — V. 99. — P. 679. — DOI: 10.1073/pnas.022642299. — ads: 2002PNAS...99..679M.
  10. S. De Monte, F. d’Ovidio, S. Danø, P. Sørensen. Dynamical quorum sensing: Population density encoded in cellular dynamics // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. — 2007. — V. 104, no. 47. — P. 18377–18381. — DOI: 10.1073/pnas.0706089104. — MathSciNet: MR2710444. — ads: 2007PNAS..10418387M.
  11. S. M¨uller, J. Hofbauer, L. Endler, C. Flamm, S. Widder, P. Schuster. A generalized model of the repressilator // J. Math. Biol. — 2006. — V. 53. — P. 905–937. — DOI: 10.1007/s00285-006-0035-9. — MathSciNet: MR2272332.
  12. J. Stricker, S. Cookson, M. Bennet, W. Mather, L. Tsimring, J. Hasty. A fast, robust and tunable synthetic gene oscillator // Nature. — 2008. — V. 456. — P. 516–519. — DOI: 10.1038/nature07389. — ads: 2008Natur.456..516S.
  13. M. Tigges, T. Marquez-Lago, J. Stelling, M. Fussenegger. A tunable synthetic mammalian oscillator // Nature. — 2009. — V. 457. — P. 309–312. — DOI: 10.1038/nature07616. — ads: 2009Natur.457..309T.
  14. E. Ullner, A. Koseska, J. Kurths, E. Volkov, H. Kantz, J. Garc´ıa-Ojalvo. Multistability of synthetic genetic networks with repressive cell-to-cell communication // Phys. Rev. E. — 2008. — V. 78. — P. 031904. — DOI: 10.1103/PhysRevE.78.031904. — ads: 2008PhRvE..78c1904U.
  15. E. Ullner, A. Zaikin, E. Volkov, J. Garc´ıa-Ojalvo. Multistability and clustering in a population of synthetic genetic oscillators via phase-repulsive cell-to-cell communication // Phys. Rev. L. — 2007. — V. 99. — P. 148103. — DOI: 10.1103/PhysRevLett.99.148103. — ads: 2007PhRvL..99n8103U.
  16. C. Waters, B. Bassler. Quorum sensing: cell-to-cell communication in bacteria // Ann. Rev. Cell Dev. Biol. — 2005. — V. 21. — P. 319–346. — DOI: 10.1146/annurev.cellbio.21.012704.131001.
  17. T. Zhou, J. Zhang, Z. Yuan, L. Chen. Synchronization of genetic oscillators // Chaos. — 2008. — V. 18. — P. 037126. — MathSciNet: MR2464337. — ads: 2008Chaos..18c7126Z.
  18. Л. Н. Григоров, М. С. Полякова, Д. С. Чернавский. Модельное исследование триггерных схем и процесса дифференциации // Молек. биология. — 1967. — Т. 1, № 3. — С. 410–418.
  19. Г. Ю. Ризниченко. Лекции по математическим моделям в биологии. — М.–Ижевск: РХД, 2002.

Журнал индексируется в Scopus

Полнотекстовая версия журнала доступна также на сайте научной электронной библиотеки eLIBRARY.RU

Журнал включен в базу данных Russian Science Citation Index (RSCI) на платформе Web of Science

Международная Междисциплинарная Конференция "Математика. Компьютер. Образование"

Международная Междисциплинарная Конференция МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ.