О компьютерных экспериментах Касмана

 pdf (650K)  / Аннотация

Список литературы:

  1. S. W. Englander, N. R. Kallenbach, A. J. Heeger, et al. Nature of the open state in long polynucleotide double helices: possibility of soliton excitations // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. — 1980. — V. 77, no. 12. — P. 7222–7226. — DOI: 10.1073/pnas.77.12.7222. — ads: 1980PNAS...77.7222E.
  2. G. Gaeta, C. Reiss, M. Peyrard, T. Dauxois. Simple models of non-linear DNA dynamics // Rev Nuovo Cimento. — 1994. — V. 17. — P. 1–48. — DOI: 10.1007/BF02724511.
  3. A. A. Grinevich, A. A. Ryasik, L. V. Yakushevich. Trajectories of DNA bubbles // Chaos, Solitons & Fractals. — 2015. — V. 75. — P. 62–75. — DOI: 10.1016/j.chaos.2015.02.009. — MathSciNet: MR3326493. — ads: 2015CSF....75...62G.
  4. A. A. Grinevich, L. V. Yakushevich. Kinks behavior near the boundaries separating homogeneous regions of DNA // Mathematical Biology and Bioinformatics. — 2015. — V. 10, no. 1. — P. 164–177. — DOI: 10.17537/2015.10.164.
  5. IMA Workshop on Mathematics of DNA Structure, Function, and Interactions, September 16–21, 2007. — Electronic resource. — https://www.ima.umn.edu/2007-2008/W9.16-21.07. — accessed: 12.02.2019.
  6. A. Kasman, B. LeMesurier. Codon Bias, DNA transcription forks, and Kink-Solitons. — доклад на конференции IMA Workshop on Mathematics of DNA Structure, Function, and Interactions, September 16–21, 2007 [Electronic resource]. — http://kasmana.people.cofc.edu/DNA-soliton-poster.pdf. — accessed: 12.02.2019.
  7. M. Peyrard, T. Dauxois. Can we model DNA at the mesoscale? // Phys. Life Rev. — 2014. — V. 11. — P. 173–175. — DOI: 10.1016/j.plrev.2014.03.008. — ads: 2014PhLRv..11..173P.
  8. M. Peyrard. Nonlinear dynamics and statistical physics of DNA // Nonlinearity. — 2004. — V. 17. — P. R1–R40. — DOI: 10.1088/0951-7715/17/2/R01. — MathSciNet: MR2039047.
  9. M. Salerno. Discrete model for DNA-promoter dynamics // Phys.Rev. A. — 1991. — V. 44. — P. 5292–5297. — DOI: 10.1103/PhysRevA.44.5292. — MathSciNet: MR1133848. — ads: 1991PhRvA..44.5292S.
  10. S. Takeno, S. Homma. Topological Solitons and Modulated Structure of Bases in DNA Double Helices: A Dynamic Plane Base-Rotator Model // Prog. Theor. Phys. — 1983. — V. 70, no. 1. — P. 308–311. — DOI: 10.1143/PTP.70.308. — ads: 1983PThPh..70..308T.
  11. L.V. Yakushevich. Nonlinear DNA dynamics: a new model // Phys. Letters A. — 1989. — V. 136, no. 7-8. — P. 413–417. — DOI: 10.1016/0375-9601(89)90425-8. — ads: 1989PhLA..136..413Y.
  12. L. V. Yakushevich. Nonlinear Physics of DNA. — Wiley, 2004.
  13. S. Yomosa. Soliton excitations in deoxyribonucleic acid (DNA) double helices // Phys. Rev. A. — 1983. — V. 27, no. 4. — P. 2120–2125. — DOI: 10.1103/PhysRevA.27.2120. — MathSciNet: MR0700064. — ads: 1983PhRvA..27.2120Y.
  14. Л. В. Якушевич, Л. А. Кpаcнобаева. Особенности динамки кинка в неоднородной ДНК // Биофизика. — 2008. — Т. 53, № 1. — С. 36–41.
    • L. V. Yakushevich, L. A. Krasnobaeva. Peculiar features of kink dynamics in inhomogeneous DNA // Biophysics. — 2008. — V. 53, no. 1. — P. 21–25.
    • L. V. Yakushevich, L. A. Krasnobaeva. Osobennosti dinamiki kinka v neodnorodnoi DNK // Biofizika. — 2008. — V. 53, no. 1. — P. 36–41. — in Russian.

Полнотекстовая версия журнала доступна также на сайте научной электронной библиотеки eLIBRARY.RU

Журнал входит в Перечень российских рецензируемых научных журналов, в которых должны быть опубликованы основные научные результаты диссертаций на соискание ученых степеней доктора и кандидата наук ВАК, группы специальностей: 01.01.00, 01.02.00.
 

Международная Междисциплинарная Конференция "Математика. Компьютер. Образование"

Международная Междисциплинарная Конференция МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ.

Журнал включен в базу данных Russian Science Citation Index (RSCI) на платформе Web of Science

Журнал индексируется в Scopus