Все выпуски

Движение открытых состояний ДНК под действием случайной силы

Гриневич А.А., Рясик А.А., Якушевич Л.В.
 pdf (6083K)  / Аннотация

Список литературы:

  1. А. А. Гриневич, А. А. Рясик, Л. В. Якушевич. Динамические свойства полинуклеотидной цепи, состоящей из двух неодинаковых однородных последовательностей, разделенных границей // Компьютерные исследования и моделирование. — 2013. — Т. 5, № 2. — С. 241–253. — DOI: 10.20537/2076-7633-2013-5-2-241-253
  2. А. А. Гриневич, А. А. Рясик, Л. В. Якушевич. Траектории движения кинков в неоднородном потенциальном поле ДНК / Математическая биология и биоинформатика: V Международная конференция. — 2014. — С. 34.
  3. Д. Ф. Кузнецов. Некоторые вопросы теории численного решения стохастических дифференциальных уравнений Ито // Дифференциальные уравнения и процессы управления. — 1998. — Т. 1. — С. 66–367.
  4. К. В. Шайтан, К. Б. Терёшкина. Молекулярная динамика белков и пептидов. — Методическое пособие. — М: Кафедра биоинженерии биологического факультета МГУ, 2004.
  5. Л. В. Якушевич, Л. А. Краснобаева, А. В. Шаповалов, Н. Р. Кинтеро. Одно- и двухсолитонные решения уравнения синус-Гордона в приложении к ДНК // Биофизика. — 2005. — Т. 50. — С. 450–455.
  6. Л. В. Якушевич, А. А. Рясик. Динамические характеристики кинков и антикинков ДНК // Компьютерные исследования и моделирование. — 2012. — Т. 4, № 1. — С. 209–217. — DOI: 10.20537/2076-7633-2012-4-1-209-217
  7. S. W. Englander, N. R. Kallenbach, A. J. Heeger, et al. Nature of the open state in long polynucleotide double helices: possibility of soliton excitations // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 1980. — V. 77, no. 12. — P. 7222–7226. — DOI: 10.1073/pnas.77.12.7222. — ads: 1980PNAS...77.7222E.
  8. E. Giudice, P. V´arnai, R. Lavery. Base pair opening within B-DNA: free energy pathways for GC and AT pairs from umbrella sampling simulations // Nucleic acids research. — 2003. — V. 31, no. 5. — P. 1434–1443. — DOI: 10.1093/nar/gkg239.
  9. A. Montrichok, G. Gruner, G. Zocchi. Trapping intermediates in the melting transition of DNA oligomers // EPL (Europhysics Letters). — 2003. — V. 62, no. 3. — P. 452. — DOI: 10.1209/epl/i2003-00417-3. — ads: 2003EL.....62..452M.
  10. V. Muto, P. S. Lomdahl, P. L. Christiansen. Two-dimensional discrete model for DNA dynamics: Longitudinal wave propagation and denaturation // Physical Review A. — 1990. — V. 42, no. 12. — P. 7452–7459. — DOI: 10.1103/PhysRevA.42.7452. — ads: 1990PhRvA..42.7452M.
  11. L. V. Yakushevich. Nonlinear physics of DNA. — John Wiley & Sons, 2006.
  12. L. V. Yakushevich, A. A. Grinevich, A. A. Ryasik. Simulation of a kink movement in homogeneous and heterogeneous DNA // RJNAMM. — 2014. — V. 29, no. 3. — P. 197–204.
  13. Y. Zeng, A. Montrichok, G. Zocchi. Length and statistical weight of bubbles in DNA melting // Physical review letters. — 2003. — V. 91, no. 14. — P. 148101. — DOI: 10.1103/PhysRevLett.91.148101. — ads: 2003PhRvL..91n8101Z.

Журнал индексируется в Scopus

Полнотекстовая версия журнала доступна также на сайте научной электронной библиотеки eLIBRARY.RU

Журнал входит в систему  Российского индекса научного цитирования.

Журнал включен в базу данных Russian Science Citation Index (RSCI) на платформе Web of Science

Международная Междисциплинарная Конференция "Математика. Компьютер. Образование"

Международная Междисциплинарная Конференция МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ.

Copyright © 2009–2024 Институт компьютерных исследований